天然纖維哪家強(qiáng)?還數(shù)種植歷史悠久的棉花。棉花具有天然、可再生的特點(diǎn)。近日,中外科學(xué)家合作揭示了整合多種方法組裝的異源四倍體棉花的基因組序列,為棉花纖維的遺傳改良提供了參考。該成果12月4日在線發(fā)表于《自然—遺傳學(xué)》。
全球每年天然紡織纖維產(chǎn)量的90%以上源于異源四倍體棉花(陸地棉和海島棉)。陸地棉因其產(chǎn)量較高,廣泛種植于世界各地,海島棉則因其優(yōu)異的纖維品質(zhì)而備受珍視。為了培育更長(zhǎng)、更細(xì)和更強(qiáng)纖維的陸地棉,可將海島棉的優(yōu)良纖維性狀引入其中。
為了得到更精確的基因組序列,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳改良國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室張獻(xiàn)龍團(tuán)隊(duì)及合作者,通過(guò)第三代測(cè)序技術(shù)、BioNano光學(xué)圖譜技術(shù)和染色質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)捕獲技術(shù),對(duì)陸地棉TM-1及海島棉3-79的基因組序列進(jìn)行聯(lián)合組裝。與先前報(bào)道的棉花基因組草圖相比,該研究顯著提高了基因組的連續(xù)性和完整性,比如著絲粒等重復(fù)含量較高的區(qū)域被成功組裝。
論文第一作者、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)博士王茂軍對(duì)《中國(guó)科學(xué)報(bào)》表示,為了將這些基因組變異應(yīng)用到棉花纖維的遺傳改良中,研究人員對(duì)陸地棉和海島棉之間的遺傳導(dǎo)入系材料進(jìn)行基因組分析,鑒定了13個(gè)控制纖維品質(zhì)的遺傳位點(diǎn)。研究團(tuán)隊(duì)還結(jié)合纖維發(fā)育的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),探究了這些遺傳位點(diǎn)的表達(dá)調(diào)控機(jī)制。
“這些位點(diǎn)的鑒定為今后通過(guò)海島棉改良陸地棉的纖維品質(zhì)提供了參考。”王茂軍說(shuō)。
該成果有助于對(duì)棉花進(jìn)化及功能基因組展開進(jìn)一步研究,并為以改良纖維為目的的育種工作提供幫助。